Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX6

Gm16286, MCG141091, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16286Q9CQX6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm16286Q9CQX6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm16286Q9CQX6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm16286Q9CQX6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm16286Q9CQX6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm16286Q9CQX6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm16286Q9CQX6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm16286Q9CQX6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm16286Q9CQX6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm16286Q9CQX6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm16286Q9CQX6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm16286Q9CQX6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm16286Q9CQX6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm16286Q9CQX6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm16286Q9CQX6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms