Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ifitm3Q9CQW9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Ifitm3Q9CQW9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Ifitm3Q9CQW9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ifitm3Q9CQW9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ifitm3Q9CQW9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ifitm3Q9CQW9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms