Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Trappc2Q9CQP2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Trappc2Q9CQP2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Trappc2Q9CQP2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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