Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms