Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms