Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms