Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms