Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE0

Rnf138, E3 ubiquitin-protein ligase RNF138, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138Q9CQE0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf138Q9CQE0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms