Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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