Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms