Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms