Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Use1Q9CQ56 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Use1Q9CQ56 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Use1Q9CQ56 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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Use1Q9CQ56 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Use1Q9CQ56 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Use1Q9CQ56 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Use1Q9CQ56 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Use1Q9CQ56 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Use1Q9CQ56 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Use1Q9CQ56 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Use1Q9CQ56 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Use1Q9CQ56 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Use1Q9CQ56 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Use1Q9CQ56 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Use1Q9CQ56 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Use1Q9CQ56 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Use1Q9CQ56 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Use1Q9CQ56 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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