Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssxb1Q9CPU1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms