Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPQ3

Tomm22, Mitochondrial import receptor subunit TOM22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm22Q9CPQ3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tomm22Q9CPQ3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tomm22Q9CPQ3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tomm22Q9CPQ3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tomm22Q9CPQ3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tomm22Q9CPQ3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tomm22Q9CPQ3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tomm22Q9CPQ3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tomm22Q9CPQ3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tomm22Q9CPQ3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tomm22Q9CPQ3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tomm22Q9CPQ3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tomm22Q9CPQ3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tomm22Q9CPQ3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tomm22Q9CPQ3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tomm22Q9CPQ3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tomm22Q9CPQ3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tomm22Q9CPQ3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tomm22Q9CPQ3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tomm22Q9CPQ3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tomm22Q9CPQ3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tomm22Q9CPQ3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tomm22Q9CPQ3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tomm22Q9CPQ3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tomm22Q9CPQ3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tomm22Q9CPQ3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tomm22Q9CPQ3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tomm22Q9CPQ3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tomm22Q9CPQ3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tomm22Q9CPQ3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tomm22Q9CPQ3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tomm22Q9CPQ3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tomm22Q9CPQ3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tomm22Q9CPQ3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tomm22Q9CPQ3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tomm22Q9CPQ3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tomm22Q9CPQ3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tomm22Q9CPQ3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tomm22Q9CPQ3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tomm22Q9CPQ3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tomm22Q9CPQ3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tomm22Q9CPQ3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tomm22Q9CPQ3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tomm22Q9CPQ3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tomm22Q9CPQ3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms