Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms