Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nup155Q99P88 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nup155Q99P88 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nup155Q99P88 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nup155Q99P88 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nup155Q99P88 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nup155Q99P88 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nup155Q99P88 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nup155Q99P88 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nup155Q99P88 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nup155Q99P88 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nup155Q99P88 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nup155Q99P88 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nup155Q99P88 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nup155Q99P88 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms