Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mrpl43Q99N89 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms