Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ms4a4dQ99N05 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms