Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR8

Mccc1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc1Q99MR8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms