Protein–RNA interactions for Protein: Q99M51

Nck1, Cytoplasmic protein NCK1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nck1Q99M51 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nck1Q99M51 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms