Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms