Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cstf3Q99LI7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cstf3Q99LI7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cstf3Q99LI7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cstf3Q99LI7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cstf3Q99LI7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cstf3Q99LI7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms