Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp5lQ99LH9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp5lQ99LH9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp5lQ99LH9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp5lQ99LH9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp5lQ99LH9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp5lQ99LH9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp5lQ99LH9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp5lQ99LH9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp5lQ99LH9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp5lQ99LH9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp5lQ99LH9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp5lQ99LH9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp5lQ99LH9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms