Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcf2Q99LE6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms