Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms