Protein–RNA interactions for Protein: Q99KI3

Emc3, ER membrane protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emc3Q99KI3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Emc3Q99KI3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Emc3Q99KI3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Emc3Q99KI3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Emc3Q99KI3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Emc3Q99KI3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Emc3Q99KI3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emc3Q99KI3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emc3Q99KI3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emc3Q99KI3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emc3Q99KI3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emc3Q99KI3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emc3Q99KI3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emc3Q99KI3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emc3Q99KI3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emc3Q99KI3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Emc3Q99KI3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Emc3Q99KI3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emc3Q99KI3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emc3Q99KI3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emc3Q99KI3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emc3Q99KI3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emc3Q99KI3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emc3Q99KI3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emc3Q99KI3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emc3Q99KI3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Emc3Q99KI3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emc3Q99KI3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emc3Q99KI3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emc3Q99KI3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emc3Q99KI3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emc3Q99KI3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emc3Q99KI3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emc3Q99KI3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emc3Q99KI3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emc3Q99KI3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emc3Q99KI3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emc3Q99KI3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emc3Q99KI3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emc3Q99KI3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emc3Q99KI3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emc3Q99KI3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emc3Q99KI3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emc3Q99KI3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emc3Q99KI3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emc3Q99KI3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emc3Q99KI3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms