Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Dok4Q99KE3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Dok4Q99KE3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dok4Q99KE3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Dok4Q99KE3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Dok4Q99KE3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Dok4Q99KE3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Dok4Q99KE3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Dok4Q99KE3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Dok4Q99KE3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Dok4Q99KE3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Dok4Q99KE3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Dok4Q99KE3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Dok4Q99KE3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Dok4Q99KE3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Dok4Q99KE3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms