Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE1

Me2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me2Q99KE1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Me2Q99KE1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms