Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrabdQ99JY4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms