Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms