Protein–RNA interactions for Protein: Q99JF8

Psip1, PC4 and SFRS1-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psip1Q99JF8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Psip1Q99JF8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms