Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctu1Q99J10 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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