Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms