Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms