Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms