Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Csmd1Q923L3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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