Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nrif1Q923B3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nrif1Q923B3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Nrif1Q923B3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms