Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spdl1Q923A2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms