Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim59Q922Y2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms