Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clip1Q922J3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms