Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tubb6Q922F4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms