Protein–RNA interactions for Protein: Q921I2

Klhdc4, Kelch domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc4Q921I2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhdc4Q921I2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms