Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smarca5Q91ZW3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms