Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZU9

Grin3b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3bQ91ZU9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin3bQ91ZU9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms