Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atl3Q91YH5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms