Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y12

Pcdha8, Protocadherin alpha 8, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha8Q91Y12 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdha8Q91Y12 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pcdha8Q91Y12 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pcdha8Q91Y12 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pcdha8Q91Y12 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pcdha8Q91Y12 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pcdha8Q91Y12 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pcdha8Q91Y12 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdha8Q91Y12 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdha8Q91Y12 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdha8Q91Y12 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdha8Q91Y12 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdha8Q91Y12 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdha8Q91Y12 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdha8Q91Y12 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdha8Q91Y12 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdha8Q91Y12 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdha8Q91Y12 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdha8Q91Y12 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdha8Q91Y12 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdha8Q91Y12 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdha8Q91Y12 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms