Protein–RNA interactions for Protein: Q91XT4

Sec16b, Protein transport protein Sec16B, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec16bQ91XT4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms