Protein–RNA interactions for Protein: Q91WL6

Snx11, Sorting nexin-11, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx11Q91WL6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms