Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms