Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bgrl3Q91VW3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bgrl3Q91VW3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bgrl3Q91VW3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bgrl3Q91VW3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bgrl3Q91VW3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bgrl3Q91VW3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bgrl3Q91VW3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bgrl3Q91VW3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bgrl3Q91VW3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bgrl3Q91VW3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bgrl3Q91VW3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bgrl3Q91VW3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bgrl3Q91VW3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bgrl3Q91VW3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bgrl3Q91VW3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bgrl3Q91VW3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bgrl3Q91VW3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bgrl3Q91VW3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bgrl3Q91VW3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bgrl3Q91VW3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bgrl3Q91VW3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bgrl3Q91VW3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bgrl3Q91VW3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bgrl3Q91VW3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bgrl3Q91VW3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms